二是巩固完善国家基本药物制度，把制度实施范围扩大到村卫生室和非政府办基层医疗卫生机构，建立药品生产流通新秩序，理顺医药价格体系，巩固完善基层医疗机构运行新机制。
三是全面推进公立医院改革，坚持公立医院的公益性质，推进政事分开、管办分开、医药分开、营利性和非营利性分开，改革“以药补医”机制，完善公立医院管理体制，搞好便民服务。加强医疗卫生人才队伍建设。提高政府卫生投入比重。鼓励和引导社会资本开办医疗机构，形成多元化办医格局，发展和健全非基本医疗卫生服务体系。
会议认为，医药卫生体制改革两年多以来，五项重点任务取得了阶段性成果。具体体现为
基本医疗保障制度基本实现全覆盖，全国城乡参保人数达到了12.95亿，人口覆盖率达到95%；基本药物制度在基层初步建立，基本药物售价比制度实施前下降16.9%，群众用药负担明显减轻；国家对基本和重大公共卫生服务投入力度加大，数亿群众得到实惠；公立医院改革试点以及县级医院综合改革试点有序推进。
